Das Sommerekzem ist eine allergische Hauterkrankung: Das Immunsystem reagiert stärker als normal auf ein bestimmtes Eiweiß im Speichel von Mücken der Gattung Culicoides. Dadurch entsteht rund um die Stiche ein starker Juckreiz und betroffene Pferde scheuern sich die betroffenen Stellen schnell wund.
Betroffen sind alle Rassen, wobei Robustrassen wie Haflinger, Norweger und Friesen sowie importierte Criollos und Isländer stärker zu einem Sommerekzem neigen. Die Hypersensitivität ist vererblich, wahrscheinlich spielen aber auch Umweltfaktoren wie eine zu reichhaltige Ernährung, Bewegungsmangel und Stress eine Rolle.